Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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