Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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NEDD8Q15843 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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