Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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