Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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