Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL3Q13618 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CUL3Q13618 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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CUL3Q13618 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CUL3Q13618 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CUL3Q13618 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL3Q13618 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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