Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
IRF5Q13568 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRF5Q13568 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms