Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms