Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SP140Q13342 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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SP140Q13342 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SP140Q13342 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SP140Q13342 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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SP140Q13342 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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SP140Q13342 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SP140Q13342 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SP140Q13342 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SP140Q13342 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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