Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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