Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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