Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3AP98173 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM3AP98173 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms