Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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RTL8BQ17RB0 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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RTL8BQ17RB0 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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RTL8BQ17RB0 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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RTL8BQ17RB0 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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