Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PTPRNQ16849 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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PTPRNQ16849 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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