Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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