Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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DDB1Q16531 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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