Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD8Q15843 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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