Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms