Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRKD1Q15139 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms