Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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COL9A2Q14055 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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COL9A2Q14055 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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COL9A2Q14055 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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COL9A2Q14055 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A2Q14055 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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