Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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