Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCINQ13939 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CCINQ13939 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CCINQ13939 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCINQ13939 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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