Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NEUROD1Q13562 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms