Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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