Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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