Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NFX1Q12986 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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