Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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FOXF2Q12947 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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FOXF2Q12947 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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FOXF2Q12947 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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FOXF2Q12947 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXF2Q12947 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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