Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TPRNQ4KMQ1 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TPRNQ4KMQ1 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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