Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms