Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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RTL8BQ17RB0 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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RTL8BQ17RB0 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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RTL8BQ17RB0 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RTL8BQ17RB0 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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