Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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