Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SGCAQ16586 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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