Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SNAPC1Q16533 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SNAPC1Q16533 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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SNAPC1Q16533 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SNAPC1Q16533 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SNAPC1Q16533 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SNAPC1Q16533 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SNAPC1Q16533 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNAPC1Q16533 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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