Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNCBQ16143 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNCBQ16143 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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