Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
HMGN3Q15651 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMGN3Q15651 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
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