Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NFIXQ14938 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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