Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCN5AQ14524 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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