Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CACNA1CQ13936 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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