Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHROOM2Q13796 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms