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| FHL3 | Q13643 | RNU6-1304P-201 | ENST00000411374 | 106 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | RHEBP3-201 | ENST00000411920 | 351 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
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| FHL3 | Q13643 | BCHE-201 | ENST00000264381 | 2454 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF99-202 | ENST00000596209 | 7817 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | LIG4-201 | ENST00000356922 | 4096 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC023632.4-201 | ENST00000517783 | 191 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC010653.1-201 | ENST00000571108 | 881 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC020895.1-201 | ENST00000595362 | 272 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC011494.1-201 | ENST00000596454 | 237 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC016747.2-202 | ENST00000607743 | 332 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC009229.3-201 | ENST00000608056 | 282 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC011890.2-201 | ENST00000613393 | 294 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | DLEU2_5.1-201 | ENST00000615567 | 84 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | NFAT5-203 | ENST00000393742 | 13067 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | CFTR-201 | ENST00000003084 | 6132 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | LCOR-204 | ENST00000371103 | 10342 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | ASAH1-265 | ENST00000637922 | 2297 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | AP001486.2-201 | ENST00000561652 | 5113 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC010889.1-201 | ENST00000566193 | 2666 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | OFD1P6Y-202 | ENST00000451061 | 2724 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | PLS1-201 | ENST00000337777 | 3755 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | ACEA_U3.1-201 | ENST00000363057 | 217 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-799P-201 | ENST00000363567 | 107 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.158-201 | ENST00000363651 | 101 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-702P-201 | ENST00000364982 | 107 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORA62.3-201 | ENST00000365110 | 153 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | DAZ4-202 | ENST00000382314 | 3910 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR521-1-201 | ENST00000384902 | 87 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR767-201 | ENST00000390228 | 109 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU1-101P-201 | ENST00000391171 | 127 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | STON1-GTF2A1L-202 | ENST00000394754 | 3824 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FHL3 | Q13643 | CYCSP19-201 | ENST00000411715 | 316 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |