Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTCH1Q13635 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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