Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms