Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms