Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms