Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTGDRQ13258 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTGDRQ13258 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTGDRQ13258 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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