Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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IFT88Q13099 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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