Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HSPB3Q12988 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HSPB3Q12988 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HSPB3Q12988 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HSPB3Q12988 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HSPB3Q12988 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HSPB3Q12988 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
HSPB3Q12988 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HSPB3Q12988 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HSPB3Q12988 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HSPB3Q12988 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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