Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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