Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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ERVV-2B6SEH9 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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ERVV-2B6SEH9 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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