Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF548Q8NEK5 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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