Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms